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1、防止温度过高
储藏温度过高，种子呼吸作用旺盛，会过多消耗自身贮存的营养，降低发芽率，因此要求贮藏种子的环境温度最好在10℃左右，切忌把种子放在火炉较近的地方。
2、控制种子含水量
防霉变关键是控制种子本身所含的水分。禾谷类作物种子含水量为12%～13%，油料作物种子为8%～9%，若含水量过高，则易发生霉变，尤其是花生、大豆、玉米等含油脂和淀粉较多的作物种子更应注意。种子贮藏要彻底清除作物茎叶、杂草、土等杂物，并对贮藏室以及贮藏用具进行严格的消毒，以免种子在贮藏过程中受污染物影响而发霉。种子应该放在干燥、通风处保管，不能和地面直接接触，要用砖、木板等垫起，防止种子受潮。也不能被雨淋和雪盖。
3、避免混杂
不少作物的种子与一般粮食不易区分，稍不注意就会造成种粮混杂。影响来年产量。种子包装袋内外都要贴上标签，标明品种、类型、数量，严防混杂。
4、避免种子窒息
种子不能用塑料袋、腌过菜的坛子或装过农药、化肥的袋子等装种藏种贮存，因塑料袋不透气，种子在袋内被迫进行无氧呼吸，产生酒精和有机酸等有毒物质，杀死种胚，使种子失去发芽能力，同时还引起霉变。
5、切忌忽冷忽热
冬贮在室外的种子，不能因为天气变冷而搬入室内，也不能因为室温过高而把种子搬到室外。忽冷忽热的温度，会影响种子质量，降低种子发芽率。
6、防烟熏
切勿将种子储藏在常有烟熏的地方，以免降低发芽。
7、防腐蚀
注意种子不能与农药、化肥混储种子不能与农药、化肥等同室存放，因许多农药和化肥具有较强的挥发性，挥发出的气体对种子细胞和种胚危害极大，直接影响种子发芽率。
8、勤检查
种子储藏期间要勤检查，看是否受潮、虫蛀、鼠咬、发霉等现象发生。如有应及时采取措施，确保种子安全越冬，同时对冬储种子要勤翻动，一般每隔20天翻动一次，以利通风降温，保证种子质量。